Sindirim, ağız boşluğundan başlayarak mide yoluyla ince bağırsaklara kadar gıda maddelerinin parçalanması, seçimi ve emilmesi sürecidir. Midede yanma, hazımsızlık, ağza acı ekşi su gelmesi, şişkinlik gibi şikayetlerin alerjik, mikrobik veya fonksiyonel nedenleri olabilir. Uzun süre devam eden mide şikayetleri mukozanın hasar görmesine ve kötü huylu hücre farklılaşmalarına yol açabilir.
Helicobacter Pylori, Alerjik Gastrit veya Kronik Gastrit Biofeedback Cihazı ile başarılı bir şekilde tedavi edilebilir.
Bağırsakların işlevi ise alerjik süreçte büyük bir rol oynar. Alerjik bünyelerde sindirim enzimleri genellikle az çalışır, bununla birlikte bağırsak mukoza duvarlarında işlevsel zafiyet ve bağırsak bağışıklık sisteminde işlevsel bozukluk gözlemlenir.
Büyük moleküller genellikle tam olarak parçalanmazlar ve gözenekli bağırsak mukoza zarından, yoğunlaşmış bağışıklık direncinin ortaya çıkabileceği lenf dokusuna nüfuz ederler. Yerleşik bir teoriye göre bu, gıda alerjilerinin ve intoleransın gelişmesinin ana sebebidir. Bu fonksiyon bozukluğuna, bozulmuş bağırsak florası, yani mikroorganizmaların kusurlu karışımı eşlik eder. Bu durum, çok fazla şeker-beyaz un-renklendirici ve koruyucudan oluşan sağlıksız beslenmenin neden alerjilerin gelişiminde büyük rol oynadığını izah etmektedir.
Sindirim fonksiyonu bozulur; bağışıklık sistemi, patojenik bakteriler ve mantarlar tarafından bağırsak florasının değiştirilmesi suretiyle zayıflatılır. Patolojik bakteri ve maya mantarlarının sayısındaki artış, özellikle Candida albicans, zehirli alkolleri ve diğer toksinleri üretir.
Hasta genellikle, gaz, bağırsak krampları ve düzensiz bağırsak hareketleri ile artan gaz birikiminden şikayetçidir. Ancak toksinlerin bağışıklık sistemini bozduğundan, karaciğeri etkilediğinden, kan ve lenf sistemleri aracılığıyla diğer birçok bedensel işlevinin bozulduğundan habersizdir. Bozulmuş bağırsak florası, mantar istilası ve gıda intoleransları, birçok kronik gastrointestinal bozukluğun başlıca nedenlerindendir.
Laboratuvar testleri, ultrason ve muhtemelen kolonoskopi ile bilinen tıbbi yöntemler kullanılarak yapılan dikkatli analizler ve bir tıp uzmanına danışması için hasta teşvik edilir. Tamamlayıcı olarak da, Çölyak, Ülser, Gastrit, Mide Bağırsak gazları, ishal ve kabızlıklar, İrritable colon sendromu (Huzursuz Bağırsak Sendromu) gibi sindirim sistemi hastalıklarının tedavisinde biofeedback terapilerinin büyük faydası tespit edilmiş, hastaların yaşamı kolaylaştırılmıştır.
Çoğu durumda, Crohn hastalığı ve ülseratif kolitte olduğu gibi kronik enflamatuar süreçler bile, hedefe yönelik biofeedback analizi ile destek tedavisi verilebilir.